A faj legfontosabb táplálékforrásai a fenyőmagok (Pinus sp.), elsősorban a fehér fenyő (Pinus subgenus Strobus) két hideg éghajlatú (magashegyi), nagy magvú fajának, a P. albicaulisnak és a P. flexilisnek a magjai, de más magashegyi fajokat is használ, mint a P. balfouriana, a P. longaeva és a P. monticola. Az alacsonyabb tengerszint feletti magasságokba való vándorlás során a pinyon fenyők magjait is nagymértékben használja. Az elszigetelt Cerro Potosí-i populáció erősen kötődik a helyi endemikus Potosi pinyon Pinus culminicola fenyőfajtához. Minden Clark-diótörőnek van egy nyelv alatti tasakja, amely a magok méretétől függően körülbelül 50-150 magot képes befogadni; a tasak nagyban növeli a madarak képességét a magok szállítására és tárolására.
A Clark-diótörő 1-15 magból álló (átlagosan 3-4 magból álló) rejtekhelyeken tárolja a magokat, általában a földben, későbbi fogyasztásra. A tobozterméstől és a fafajtól függően egyetlen Clark-diótörő akár 98 000 magot is elrejthet egy szezonban. A madarak rendszeresen többet tárolnak, mint amennyire ténylegesen szükségük van, biztosítékként más állatok (mókusok stb.) által elkövetett maglopások, valamint az alternatív táplálék alacsony elérhetősége ellen; ez a többletmag a rejtekhelyen marad, és megfelelő körülmények esetén képes lehet kicsírázni és új fává fejlődni. Az elrejtőzés és a túlraktározás révén a madár saját élőhelyét örökíti meg. Ehhez a tárolási magatartáshoz szorosan kapcsolódik a madarak figyelemre méltó hosszú távú térbeli memóriája; a madarak még kilenc hónappal később is nagy pontossággal képesek megtalálni a magok rejtekhelyét, még akkor is, ha a rejtekhelyeket akár egy méteres hó borítja. Emlékezőképessége a Corvidae magas intelligenciáját példázza.
A táplálékában rovarzsákmányok, bogyók és más gyümölcsök, kisemlősök és esetenként tetemek húsa is szerepel. A tojásokat és a fészekaljakat néha felfalják, a mogyoró és a szarvasmarha pedig a madárasztalok kedvencévé vált. A táplálékot a földről és a fákról is felszedik, ahol a diótörők nagyon fürgék az ágak között. A madarak úgy tudják kiszedni a táplálékot, hogy a fenyőtobozokat úgy fogják meg, hogy a tobozokat az egyik vagy mindkét lábuk közé szorítják. A madarak ezután erős csőrükkel feltörik a tobozokat. A korhadt fatörzseket is feltörik, hogy nagy bogárlárvákat találjanak, és az állati trágyát is átforgathatják rovarok után kutatva. A Clark-diótörők fejlett területeken is opportunista táplálkozók lehetnek, és egyesek “táborrablóként” ismerik őket.