Os recursos alimentares mais importantes para esta espécie são as sementes de pinheiros (Pinus sp.), principalmente as duas espécies de pinheiro branco (Pinus subgénero Strobus) de clima frio (Pinus sp.) com sementes grandes P. albicaulis e P. flexilis, mas também utilizando outras espécies de altitude como P. balfouriana, P. longaeva e P. monticola. Durante as migrações para altitudes mais baixas, também utiliza extensivamente as sementes de pinheiro bravo. A população isolada de Cerro Potosí está fortemente associada com a endêmica Potosi pinyon Pinus culminicola local. Todos os quebra-nozes Clark’s possuem uma bolsa sublingual capaz de conter cerca de 50-150 sementes, dependendo do tamanho das sementes; a bolsa aumenta muito a capacidade das aves de transportar e armazenar sementes.
Clark’s nutcrackers armazenam sementes, geralmente no solo para consumo posterior, em caches de 1-15 sementes (média de 3-4 sementes). Dependendo da cultura do cone assim como da espécie de árvore, um único quebra-nozes Clark’s pode armazenar até 98.000 sementes por estação. As aves armazenam regularmente mais do que realmente precisam como seguro contra roubo de sementes por outros animais (esquilos, etc.), assim como a baixa disponibilidade de alimentos alternativos; este excedente de sementes é deixado na cache, e pode ser capaz de germinar e crescer em novas árvores, se as condições forem adequadas. Através desta actividade de caching e over-storing, a ave está a perpetuar o seu próprio habitat. Estreitamente ligada a este comportamento de armazenamento está a notável memória espacial a longo prazo da ave; elas são capazes de realocar as caches de sementes com grande precisão, mesmo nove meses depois, e mesmo quando os locais de cache são enterrados sob até um metro de neve. Os seus poderes de memória exemplificam a alta inteligência do Corvidae.
A dieta também inclui uma vasta gama de presas de insectos, bagas e outros frutos, pequenos mamíferos e ocasionalmente carne de carcaças. Ovos e filhotes são às vezes devorados, e amendoins e sebo se tornaram os favoritos nas mesas das aves. Os alimentos são tirados tanto do solo como das árvores, onde os quebra-nozes são muito ágeis entre os ramos. As aves são capazes de extrair o alimento apertando as pinhas de forma que as pinhas sejam mantidas entre um ou ambos os pés. As aves abrem então os cones com as suas contas fortes. Os troncos podres também são pirateados a fim de localizar grandes larvas de escaravelhos, e o esterco dos animais pode ser virado em busca de insectos. Os quebra-nozes da Clark também podem ser alimentadores oportunistas em áreas desenvolvidas, e são conhecidos por alguns como “ladrões do acampamento”.