Le risorse alimentari più importanti per questa specie sono i semi di pini (Pinus sp.), principalmente le due specie da clima freddo (alta quota) di pino bianco (Pinus subgenus Strobus) con semi grandi P. albicaulis e P. flexilis, ma anche utilizzando altre specie d’alta quota come P. balfouriana, P. longaeva e P. monticola. Durante le migrazioni ad altitudini più basse, utilizza anche ampiamente i semi di pini pinyon. La popolazione isolata di Cerro Potosí è fortemente associata con l’endemico locale Pinus culminicola di Potosi. Tutti gli schiaccianoci di Clark hanno un sacchetto sublinguale in grado di contenere circa 50-150 semi, a seconda delle dimensioni dei semi; il sacchetto migliora notevolmente la capacità degli uccelli di trasportare e conservare i semi.
Gli schiaccianoci di Clark conservano i semi, di solito nel terreno per il consumo successivo, in cache di 1-15 semi (media di 3-4 semi). A seconda del raccolto di pigne e delle specie di alberi, un singolo Clark’s nutcracker può immagazzinare fino a 98.000 semi a stagione. Gli uccelli immagazzinano regolarmente più di quanto hanno effettivamente bisogno come assicurazione contro il furto di semi da parte di altri animali (scoiattoli, ecc.), così come la bassa disponibilità di cibi alternativi; questo surplus di semi viene lasciato nella cache, e può essere in grado di germinare e crescere in nuovi alberi, se le condizioni sono giuste. Attraverso questa attività di cache e over-storing, l’uccello sta perpetuando il proprio habitat. Strettamente legato a questo comportamento di stoccaggio è la notevole memoria spaziale a lungo termine dell’uccello; sono in grado di ricollocare le cache di semi con grande precisione, anche nove mesi dopo, e anche quando i siti di cache sono sepolti sotto fino a un metro di neve. I suoi poteri di memoria esemplificano l’alta intelligenza dei Corvidae.
La dieta include anche una vasta gamma di prede di insetti, bacche e altri frutti, piccoli mammiferi e occasionalmente carne di carcasse. Uova e nidiacei sono talvolta divorati, e le arachidi e il sugna sono diventati i preferiti sulle tavole degli uccelli. Il cibo viene preso sia da terra che dagli alberi, dove gli schiaccianoci sono molto agili tra i rami. Gli uccelli sono in grado di estrarre il cibo afferrando le pigne in modo tale che le pigne siano tenute tra uno o entrambi i piedi. Gli uccelli poi aprono le pigne con il loro forte becco. I tronchi marci sono anche incisi al fine di individuare grandi larve di coleotteri, e lo sterco di animali può essere capovolto alla ricerca di insetti. Gli schiaccianoci di Clark possono anche essere opportunisti nelle aree sviluppate, e sono conosciuti da alcuni come “ladri di campi”.